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独立学院自1999年正式创立以来，经过近十年的迅速发展，至今已有318所，在校生人数达186.6万人，承担了约1/3的本科扩招任务，[1]成为高等教育系统的重要组成部分。独立学院的创办具有特定的背景，它是适应我国高等教育办学机制改革和高等教育大众化发展需求而出现的。办学机制创新与教育资源优化是独立学院创办的初衷，也更是其办学优势所在。教育部发布的8号文件和发布的26号令都强调要引导独立学院发挥办学优势，注重办学特色，规范办学行为，实现可持续发展。独立学院要获得强盛的生命力，应积极探索，实现办学机制的创新和教育资源的优化。
一、独立学院：高等教育办学机制的有益探索与教育资源的必要补充
创办与发展独立学院最突出的意义在于办学机制创新和教育资源的优化。
1.创办与发展独立学院是高等教育办学机制的有益探索
高等教育办学机制包括高等教育办学体制、运行机制、管理机制等内容。独立学院的办学机制与传统的公办高校和一般民办高校不同。在举办方式上，独立学院由公办高校联合社会力量举办；在运行机制上，独立学院按民营机制运行，其办学经费、师资来源、专业设置高度市场化；在管理机制上，独立学院管理制度由申请者和合作者共同商定，合作方参与独立学院的重大决策、监督和领导；在治理结构上，独立学院有更多的市场力量介入，实行多元主体联合治理。高等教育办学机制发展趋势是社会化、市场化、多元化并存。[1]创办和发展独立学院有利于改革高等教育单一的办学方式，引入多元化的投资主体，促进高等教育办学模式和办学主体的多样化；有利于改革高校日益行政化的运行机制，真正强化其学术主导性、教师主体性和人才培养的中心地位；有利于改革高校内部僵化的人事分配制度和低效的管理模式，建立起机构精干、人员优化、按劳分配、灵活有序、相对稳定又动态优化的内部管理机制；有利于凸显高校的自主办学地位，发挥高校办学的积极性和创造性。
2.独立学院是高等教育体系的必要部分
近年来，我国社会的快速发展使得公办高校不能满足社会对高等教育的需求，同时，财政性经费投入又滞后于高等教育规模的发展，很多地方高校生均拨款逐年下降，许多公办高等学校已经处于超负荷运转状况，教育资源非常紧张。而高等教育又是一项投入大、见效慢的事业，在目前的条件下，要实现高等教育规模的扩大，必须充分利用民间资本，支持非财政性办学实体发展。正如李岚清同志所说，高等教育要有大的扩张，必须让公办教育与民办教育“两个轮子”同时推动。[2]独立学院办学经费的筹措不依靠国家财政拨款，采取民间筹措的方式实现，而且在教学资源方面依托母体公办高校支持。所以，创办与发展独立学院，既是对高等教育体系的必要补充，它实现了社会资本与母体高校教学资源的有机结合，又能够利用母体高校办学经验和优势，确保教学质量。
3.独立学院的办学优势在于办学机制创新和教育资源优化
独立学院的典型特征是既具有独立的法人地位，又与母体高校充分实现资源共享。这种形式的高等教育机构在国外也是相当的普遍。在印度，大学就可以举办几所甚至几十所附属学院。[3]在美国，许多大学创办了分校或下设了私立学院，各分校和学院在共享大学的品牌和资源的同时，获得了较大的自主权，不少分校和学院形成了独特的办学风格，其教育质量得到了社会的认可。国外高等教育的办学实践证明，独立学院完全可以在充分吸收母体高校办学经验、利用母体高校的品牌和共享母体高校教育资源的基础上，办出特色，办出水平，而且这种办学形式具有长久的生命力。
二、发展困境：独立学院两大优势未充分发挥
1.独立学院办学机制创新不足
（1）独立学院举办权、所有权、管理权没有充分实现分离。当前，相当一部分独立学院，仍然是“校中校”，由母体高校直接管理，母体高校以管理其二级学院的模式管理独立学院，并以母体高校人才培养目标引导独立学院的教育教学活动，这不仅抑制了独立学院的办学自主性和办学灵活性，而且抑制了独立学院办学特色的形成。另一方面，部分独立学院由社会投资方掌控所有的办学事务，用企业管理模式管理独立学院，缺乏成熟的办学理念，缺乏丰富的办学经验，追求利润最大化，这不仅违背了教育公益性原则，而且违背了教育规律。
（2）独立学院运行机制不完善。在运行机制方面，许多独立学院的决策权、执行权和监督权三者的关系尚未理顺，并且决策权、执行权和监督权的行使缺乏制度规范和保障。虽然，国家规定独立学院实行以董事会领导下的院长负责制为基本运行框架，但是很多独立学院董事会形同虚设，制度不健全，职能、职责、权限设定不清晰，议事规则不科学，举办独立学院各方的责、权、利也不明确，董事会领导下的院长负责制更没有得到真正落实。此外，很多独立学院董事会成员结构
